P1140 相似基因 (dp)-白红宇

P1140 相似基因 (dp)

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发布时间：2019-06-14

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题目背景

大家都知道，基因可以看作一个碱基对序列。它包含了

在一个人类基因工作组的任务中，生物学家研究的是：两个基因的相似程度。因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用。

题目描述

两个基因的相似度的计算方法如下：

对于两个已知基因，例如

这样,两个基因之间的相似度就可以用碱基之间相似度的总和来描述，碱基之间的相似度如下表所示：

那么相似度就是：

相似度为：

输入输出格式

输入格式：

共两行。每行首先是一个整数，表示基因的长度；隔一个空格后是一个基因序列，序列中只含 $\le1≤序列的长度\le 100≤100。$

输出格式：

仅一行，即输入基因的相似度。

输入输出样例

输入样例#1：

7 AGTGATG

5 GTTAG

输出样例#1：

思路:dp[i][j]表示当前i和j匹配的最优情况我们知道有三种情况即i与j直接匹配 i和空格匹配 j和空格匹配我们选取这三个的最大值

#include
       
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                    #include
                     
                      #define ll long long intusing namespace std;inline ll gcd(ll a,ll b){ return b?gcd(b,a%b):a;}inline ll lcm(ll a,ll b){ return a/gcd(a,b)*b;}int moth[13]={ 0,31,28,31,30,31,30,31,31,30,31,30,31};int dir[2][2]={ 1,0 ,0,1};int dirs[8][2]={ 1,0 ,0,1 ,-1,0 ,0,-1, -1,-1 ,-1,1 ,1,-1 ,1,1};const int inf=0x3f3f3f3f;const ll mod=1e9+7;int c[5][5]={ { 5,-1,-2,-1,-3}, { -1,5,-3,-2,-4}, { -2,-3,5,-2,-2}, { -1,-2,-2,5,-1}, { -3,-4,-2,-1,0}}; int dp[107][107]; //i和j匹配的最优解 int main(){ ios::sync_with_stdio(false); int n,m; string a,b; cin>>n>>a>>m>>b; map
                      
                        mm; mm['A']=0; mm['C']=1; mm['G']=2; mm['T']=3; for(int i=1;i<=n;i++) for(int j=1;j<=m;j++) dp[i][j]=-inf; dp[0][0]=0; for(int i=1;i<=n;i++){ dp[i][0]=dp[i-1][0]+c[mm[a[i-1]]][4]; //初始化 } for(int i=1;i<=m;i++) dp[0][i]=dp[0][i-1]+c[4][mm[b[i-1]]]; //初始化 for(int i=1;i<=n;i++) for(int j=1;j<=m;j++){ dp[i][j]=max(dp[i][j],dp[i-1][j]+c[mm[a[i-1]]][4]); //i和空格匹配 dp[i][j]=max(dp[i][j],dp[i][j-1]+c[4][mm[b[j-1]]]); //j和空格匹配 dp[i][j]=max(dp[i][j],dp[i-1][j-1]+c[mm[a[i-1]]][mm[b[j-1]]]); //i和j匹配 } cout<
                       
                        <

转载于:https://www.cnblogs.com/wmj6/p/10747922.html

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